被继承人生前订立遗嘱指定房产归属，部分继承人一直长期实际占用、控制涉案房屋，多年间始终未提出分割异议，多年过后双方产生矛盾，未占有房屋的其他继承人，还能否向法院起诉要求依法分割遗嘱房产、确权自己的继承份额？

根据《民法典》第一千一百二十一条、第一千一百二十四条、第一百八十八条相关规定，继承从被继承人死亡时当即开始；继承人在继承开始后遗产分割前，没有以书面形式明确作出放弃继承表示的，视为接受继承。

遗产尚未实际分割、全体继承人持续保持房屋共同共有状态的，物权确权与共有物分割请求权，不适用诉讼时效的限制，无论经过多少年，继承人均有权随时提起析产分割诉讼。只有当房屋已经被私自完成过户登记、继承人明确知晓自身合法权利被侵害，超过三年仍未主张维权的，才会超出诉讼时效、丧失胜诉权利。

若法院经审理认定遗嘱合法真实有效，按照遗嘱内容确认各继承人应得房产产权份额；长期独自占有使用房屋、拒绝配合分割的一方，不能仅凭长期居住的事实直接获得房屋全部所有权。法院可依法判决房屋归某一方所有，获得房产的一方向其他权利人支付对应份额的房屋折价补偿款；或是依法对整套房产拍卖、变卖，所得价款按照法院确认的继承份额比例，在全体继承人之间公平分配。