债务人因无力清偿债务，与债权人签订以房抵债协议，约定将其名下房屋抵偿债务，债权人已实际入住房屋，但一直未办理产权变更登记。后债务人反悔，主张以房抵债协议无效，债权人能否直接起诉确认房屋归自己所有？

根据《民法典》第二百一十五条规定，以房抵债协议本质上属于双方达成的债务清偿协议，合法有效的以房抵债协议对双方具有约束力，但该协议仅产生债权效力，不直接导致房屋所有权的变动。债权人实际占有使用房屋，仅为协议履行的一部分，不能直接产生物权变动的效力。

因此，债权人不能直接起诉请求确认房屋所有权，需根据具体情况主张权利：

1.若以房抵债协议合法有效，且不存在无法履行的情形，债权人可起诉要求债务人配合办理房屋产权变更登记，完成抵债行为；

2.若房屋因债务人原因被查封、抵押，无法办理过户，债权人可主张解除以房抵债协议，要求债务人继续履行原债务，或要求债务人承担违约责任；

3.若以房抵债协议存在恶意串通损害其他债权人利益、规避法律强制性规定等情形，协议可能被认定无效，债权人需通过原债权债务关系主张权利。