部分当事人基于买卖、赠与等民事行为，已实际占有使用房屋多年，甚至进行了翻修、改建，但因政策限制、历史遗留问题、卖方失联等原因，一直未办理产权登记。现房屋面临拆迁、征收，或案外人主张房屋权利，占有人能否直接起诉要求确认房屋所有权？

根据《民法典》第二百零九条规定，不动产物权变动以登记为生效原则，仅占有使用事实不能直接产生物权变动的效力。因此，当事人即使长期占有使用房屋，也不能仅凭占有事实直接起诉确认房屋所有权。此时需区分不同情形处理：

1.若当事人之间存在合法有效的房屋买卖合同，且已履行付款、交付等主要义务，可向法院提起合同纠纷之诉，请求确认合同合法有效，并判令卖方配合办理产权变更登记；若卖方失联，可通过公告送达方式完成诉讼程序，凭生效判决办理过户。

2.若房屋属于历史遗留的无产权房屋，当事人可提交长期占有使用的证据，如水电费缴纳记录、居委会证明、邻居证言等，结合房屋来源的相关材料，向法院起诉请求确认其对房屋的占有使用权，法院可根据查明的事实确认当事人的合法占有权益。

3.若因政策原因无法办理产权登记，当事人可主张确认合同效力，并在后续符合过户条件时再办理登记手续。