确认农村宅基地房屋权利人时，首先需厘清土地使用权与地上房屋所有权的分离属性。根据《土地管理法》，宅基地使用权仅限本集体经济组织成员享有，非成员子女仅能继承房屋所有权而不得翻建或长期占用。例如某案中，被继承人去世后，其城市户籍子女主张分割宅基地房屋，因为子女不是本集体经济组织成员，所以法院判决子女可获得房屋残值补偿，但宅基地由集体收回重新分配。

其次，法院还需要审查房屋建造的实际出资与贡献，若继承人能证明对房屋建造提供主要资金或劳务，可主张更多份额。如某案中，长子出资80%建造房屋但未登记产权，次子仅提供部分建材，法院根据双方的证据，最终法院按出资比例分割房屋使用权。

最后，需考量房屋的实际使用与管理情况，长期居住并维护房屋的继承人可能因“管理贡献”获得优先权。例如某案中，三子婚后一直居住在宅基地房屋内，负责修缮漏水屋顶、缴纳水电费，其他子女未参与管理，法院判决三子获得房屋长期使用权。